Вперше створено комп'ютерну модель життєвого циклу мікроорганізму
Учение зі Стенфордського університету та Інституту ім Крейга Вентера, розробили першу комп'ютерну модель цілого мікроорганізму, скромною одноклітинної бактерії, яка живе в людських геніталіях і дихальних шляхах.
По повідомленнями експертів і вчених, дана робота стала гігантським кроком до розробки комп'ютерних лабораторій, які зможуть виробляти тисячі експериментів набагато швидше, ніж це можливо зараз. Це дозволить вченим розкрити секрети таких захворювань як рак і хвороба Альцгеймера.
"Ви щотижня читаєте в газеті про відкриття гена раку або гена болезні Альцгеймера", - сказав Маркус Коверт зі Стенфорда, який очолював це дослідження. "Тоді чому ми до цих пір не вилікували всі ці захворювання? Відповідь, звичайно, полягає в тому, що рак - це не проблема одного гена; тут мають місце тисячі чинників ".
Для медиків і біохіміків, комп'ютерні моделі дозволять значно прискорити ранні стадії пошуку нових хімічних сполук. А для молекулярних біологів, досить акуратні моделі дозволять глибше зрозуміти базові принципи життєдіяльності клітин.
Доктор Коверт сказав: "Що відрізняє нашу роботу від всіх інших, так це те, що ми включили всі гени і всі відомі функції генів".
Модель повного життєвого циклу патогена під назвою Mycoplasma genitalium, була представлена ??в п'ятницю в журналі Cell.
Все розрахунки проводяться на кластері з 128 комп'ютерів, які моделюють життєвий цикл клітини на молекулярному рівні, включаючи взаємодію 28 категорій молекул, таких як ДНК, РНК, протеїни і проміжні продукти обміну речовин під назвою метаболіти.
Учение використовували дані з понад 900 наукових публікацій, для підтвердження точності їх комп'ютерної моделі.
"На даний момент, моделювання одного поділу клітини займає 10 годин і генерує полгигабайта даних", - пише доктор Коверт.
Колічество генів цієї бактеріі становить 525, що значно менше, ніж в іншої бактерії, часто застосовується в лабораторіях, E. coli (4288 генів).
"Головне питання для всіх нас: що станеться, якщо ми змоделюємо крупніший організм, наприклад, E. coli, дріжджі або навіть, з часом, людську клітину? ", - Запитав доктор Коверт. Він зазначив, що E. coli ділиться кожні 20-30 хвилин і кількість молекулярних взаємодій при цьому значно вище, що потребують великих обчислювальних ресурсів.
"У мене буде відповідь через кілька років", - написав он.
Орігінал (на англ. Мовою): Nytimes.com
Еще из категории технологии:
- Новые открытия освещают поиски ценных "зеленых" металлов
- За пределами клонирования: использование мощи виртуального квантового вещания
- Исследовательская группа предлагает новый тип акустического кристалла с плавными, непрерывными изменениями упругих свойств
- Дроны, распространяющие комаров, могут сократить распространение болезней
- Триллионы тонн закопанного водорода: начинается золотая лихорадка чистой энергии
- Робот, распыляющий смолу, может ремонтировать газопроводы изнутри
- Мини-роботы, созданные по образцу насекомых
- Раскаленная добела тепловая сетевая батарея стремится уничтожить литий
Последние комментарии
Рассылка топовых новостей
Читательский топ
- Телескоп Джеймса Уэбба обнаруживает две экзопланеты, вращающиеся вокруг мертвых звёзд
- Астрономы обнаружили новый короткопериодический коричневый карлик
- Эволюция человеческой иммунной системы в постомикронную эпоху
- Обнаружен неожиданно крупный вид древнего млекопитающего в Патагонии
- Почему люди отрицают изменение климата? Исследование показывает неожиданные результаты
- Серые рифовые акулы меняют наши представления о том, как они дышат
- Запуск космического корабля X-37B компанией SpaceX на ракете Falcon Heavy запланирован на 28 декабря
Комментариев нет. Будьте первым!